Protein–RNA interactions for Protein: O43414

ERI3, ERI1 exoribonuclease 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERI3O43414 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERI3O43414 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERI3O43414 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERI3O43414 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
ERI3O43414 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
ERI3O43414 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERI3O43414 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERI3O43414 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
ERI3O43414 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERI3O43414 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERI3O43414 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERI3O43414 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ERI3O43414 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ERI3O43414 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms