Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXA2O43364 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms