Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 RPS3-202ENST00000422465 903 ntTSL 28.58□□□□□ -1.043e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RPS3-219ENST00000534440 564 ntTSL 2 BASIC8.12□□□□□ -1.113e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RPS3-204ENST00000525690 421 ntTSL 38.12□□□□□ -1.113e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RPS3-210ENST00000528439 473 ntTSL 38.12□□□□□ -1.113e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RPS3-214ENST00000530164 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.163e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RPS3-215ENST00000530170 531 ntTSL 57.7□□□□□ -1.183e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RPS3-203ENST00000524851 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.193e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RPS3-205ENST00000525933 1307 ntTSL 57.21□□□□□ -1.263e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RPS3-211ENST00000528847 639 ntTSL 57.16□□□□□ -1.263e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RPS3-207ENST00000526608 710 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.363e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.613e-12■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.422e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.122e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.042e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -02e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-211ENST00000461419 559 ntTSL 514.62□□□□□ -0.072e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.092e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.192e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.572e-6■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.894e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.674e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RAP1GAP-203ENST00000374757 1328 ntTSL 518.77■□□□□ 0.64e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.584e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 VASP-208ENST00000589627 696 ntTSL 317.97■□□□□ 0.474e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 VASP-211ENST00000592139 424 ntTSL 317.15■□□□□ 0.344e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.284e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ZNF274-214ENST00000621145 1646 ntTSL 216.7■□□□□ 0.264e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ZNF274-213ENST00000619307 1566 ntTSL 216.22■□□□□ 0.194e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MTA1-220ENST00000552286 1943 ntTSL 216.13■□□□□ 0.176e-9■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MTA1-211ENST00000481206 842 ntTSL 216.05■□□□□ 0.164e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.134e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.124e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 VASP-210ENST00000590603 388 ntTSL 215.78■□□□□ 0.124e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 VASP-202ENST00000586014 1725 ntTSL 515.69■□□□□ 0.14e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.094e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.084e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.064e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 TUBA3FP-201ENST00000292748 1678 ntTSL 515.32■□□□□ 0.044e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.044e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.044e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 DLK1-204ENST00000555747 538 ntTSL 415.24■□□□□ 0.034e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MTA1-208ENST00000438610 2144 ntTSL 1 (best)15.15■□□□□ 0.024e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.014e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MTA1-206ENST00000434050 2050 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -06e-9■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MAP3K6-204ENST00000472410 2530 ntTSL 1 (best)14.85□□□□□ -0.034e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 NCOA2-205ENST00000520416 526 ntTSL 314.83□□□□□ -0.042e-9■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.064e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 SLC22A18-207ENST00000463571 1030 ntTSL 514.54□□□□□ -0.084e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.14e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 VASP-203ENST00000586619 655 ntTSL 214.27□□□□□ -0.134e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ANK1-204ENST00000335651 525 ntTSL 414.17□□□□□ -0.144e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.244e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 SLC22A18-205ENST00000449603 682 ntTSL 313.4□□□□□ -0.264e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.274e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.34e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.314e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.334e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.344e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 SLC22A18-211ENST00000495518 588 ntTSL 212.53□□□□□ -0.44e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.414e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 DLK1-203ENST00000392848 555 ntTSL 412.15□□□□□ -0.464e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 PPP1R2-203ENST00000438848 839 ntTSL 512.03□□□□□ -0.484e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC11.83□□□□□ -0.524e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MTA1-215ENST00000494981 509 ntTSL 311.78□□□□□ -0.524e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 KDM3A-204ENST00000427678 565 ntTSL 211.72□□□□□ -0.534e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 HSF1-211ENST00000533130 493 ntTSL 311.67□□□□□ -0.544e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 SLC22A18-204ENST00000441077 831 ntTSL 511.62□□□□□ -0.554e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.594e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ZNF274-206ENST00000595146 4852 ntTSL 1 (best)11.29□□□□□ -0.64e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MTA1-205ENST00000426567 568 ntTSL 310.87□□□□□ -0.672e-8■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.694e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.74e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ZNF274-201ENST00000326804 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.784e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 RAP1GAP-207ENST00000447293 429 ntTSL 210.04□□□□□ -0.84e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ZNF274-211ENST00000615675 1259 ntTSL 29.9□□□□□ -0.824e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 DNAJB6-214ENST00000486083 699 ntTSL 59.44□□□□□ -0.94e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MIAT-219ENST00000616213 9943 ntTSL 1 (best)9.27□□□□□ -0.934e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 ANK1-208ENST00000518715 547 ntTSL 49.24□□□□□ -0.934e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 KDM3A-205ENST00000441719 8741 ntTSL 29.04□□□□□ -0.964e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MIAT-220ENST00000616469 10069 ntTSL 1 (best)9□□□□□ -0.974e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 DNAJB6-210ENST00000453383 590 ntTSL 48.92□□□□□ -0.984e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 PPP1R2-206ENST00000618156 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.68□□□□□ -1.024e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 PPP1R2-207ENST00000625807 245 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.054e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 PPP1R2-201ENST00000413183 706 ntTSL 58.48□□□□□ -1.054e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 KDM3A-202ENST00000409064 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.094e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 DNAJB6-205ENST00000437030 566 ntTSL 58.23□□□□□ -1.094e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MIAT-221ENST00000620145 10069 ntTSL 1 (best)7.61□□□□□ -1.194e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MIAT-218ENST00000613780 10143 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.24e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 MIAT_exon5_1.1-201ENST00000618919 149 ntBASIC7.14□□□□□ -1.274e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 DNAJB6-217ENST00000488001 551 ntTSL 47□□□□□ -1.294e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 NCOA2-202ENST00000518287 6087 ntTSL 56.15□□□□□ -1.432e-9■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.464e-7■■■■□ 25.4
RBFOX2O43251 PPP1R2-202ENST00000418939 872 ntTSL 33.06□□□□□ -1.924e-7■■■■□ 25.4
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