Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ARPC5O15511 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms