Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms