Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
BHLHE40O14503 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms