Protein–RNA interactions for Protein: O00273

DFFA, DNA fragmentation factor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DFFAO00273 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DFFAO00273 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DFFAO00273 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DFFAO00273 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DFFAO00273 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DFFAO00273 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DFFAO00273 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DFFAO00273 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DFFAO00273 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DFFAO00273 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DFFAO00273 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DFFAO00273 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DFFAO00273 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DFFAO00273 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DFFAO00273 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DFFAO00273 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms