Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
UBXN8O00124 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
UBXN8O00124 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms