Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms