Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DGG1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DGG1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DGG1 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DGG1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DGG1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DGG1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
B4DGG1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
B4DGG1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DGG1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DGG1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DGG1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DGG1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DGG1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DGG1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DGG1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DGG1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DGG1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
B4DGG1 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4DGG1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
B4DGG1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4DGG1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
B4DGG1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
B4DGG1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
B4DGG1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
B4DGG1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
B4DGG1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
B4DGG1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms