Protein–RNA interactions for Protein: B4DEV8

Proteasome subunit alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DEV8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
B4DEV8 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
B4DEV8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
B4DEV8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
B4DEV8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
B4DEV8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
B4DEV8 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms