Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
IRGMA1A4Y4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms