Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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