Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ARL2-SNX15V9GYD0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ARL2-SNX15V9GYD0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ARL2-SNX15V9GYD0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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