Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
A3GALT2U3KPV4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
A3GALT2U3KPV4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
A3GALT2U3KPV4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
A3GALT2U3KPV4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A3GALT2U3KPV4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
A3GALT2U3KPV4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
A3GALT2U3KPV4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms