Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

BIVM-ERCC5, BIVM-ERCC5 readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC45.7■■■■■ 4.91
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC45.67■■■■■ 4.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC45.66■■■■■ 4.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC45.66■■■■■ 4.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC45.63■■■■■ 4.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.6■■■■■ 4.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC45.59■■■■■ 4.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.58■■■■■ 4.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
BIVM-ERCC5R4GMW8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC45.55■■■■■ 4.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC45.55■■■■■ 4.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.55■■■■■ 4.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC45.54■■■■■ 4.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC45.53■■■■■ 4.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC45.52■■■■■ 4.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC45.52■■■■■ 4.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC45.51■■■■■ 4.88
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC45.49■■■■■ 4.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.47■■■■■ 4.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC45.46■■■■■ 4.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC45.45■■■■■ 4.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.87
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.43■■■■■ 4.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC45.43■■■■■ 4.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.43■■■■■ 4.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC45.42■■■■■ 4.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC45.41■■■■■ 4.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.4■■■■■ 4.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.39■■■■■ 4.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC45.39■■■■■ 4.86
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC45.37■■■■■ 4.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC45.34■■■■■ 4.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC45.31■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.3■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC45.29■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC45.27■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.27■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.26■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
BIVM-ERCC5R4GMW8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC45.24■■■■■ 4.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC45.21■■■■■ 4.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC45.21■■■■■ 4.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.83
BIVM-ERCC5R4GMW8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC45.18■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.16■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC45.16■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC45.15■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.14■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
BIVM-ERCC5R4GMW8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.11■■■■■ 4.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC45.1■■■■■ 4.81
BIVM-ERCC5R4GMW8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC45.07■■■■■ 4.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC45.07■■■■■ 4.8
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC45.06■■■■■ 4.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms