Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6K1

DNMT3A, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3AQ9Y6K1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
DNMT3AQ9Y6K1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
DNMT3AQ9Y6K1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
DNMT3AQ9Y6K1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
DNMT3AQ9Y6K1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.75
DNMT3AQ9Y6K1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
DNMT3AQ9Y6K1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.7 ms