Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TNPO3Q9Y5L0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNPO3Q9Y5L0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNPO3Q9Y5L0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNPO3Q9Y5L0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNPO3Q9Y5L0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNPO3Q9Y5L0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNPO3Q9Y5L0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNPO3Q9Y5L0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNPO3Q9Y5L0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNPO3Q9Y5L0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNPO3Q9Y5L0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNPO3Q9Y5L0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNPO3Q9Y5L0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNPO3Q9Y5L0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNPO3Q9Y5L0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNPO3Q9Y5L0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNPO3Q9Y5L0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNPO3Q9Y5L0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNPO3Q9Y5L0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNPO3Q9Y5L0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TNPO3Q9Y5L0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TNPO3Q9Y5L0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TNPO3Q9Y5L0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TNPO3Q9Y5L0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
TNPO3Q9Y5L0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO3Q9Y5L0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO3Q9Y5L0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO3Q9Y5L0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNPO3Q9Y5L0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO3Q9Y5L0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO3Q9Y5L0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNPO3Q9Y5L0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms