Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I0

PCDHA13, Protocadherin alpha-13, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA13Q9Y5I0 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHA13Q9Y5I0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHA13Q9Y5I0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHA13Q9Y5I0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHA13Q9Y5I0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHA13Q9Y5I0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHA13Q9Y5I0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHA13Q9Y5I0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHA13Q9Y5I0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHA13Q9Y5I0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHA13Q9Y5I0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHA13Q9Y5I0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHA13Q9Y5I0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PCDHA13Q9Y5I0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCDHA13Q9Y5I0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms