Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E1

PCDHB9, Protocadherin beta-9, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB9Q9Y5E1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCDHB9Q9Y5E1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCDHB9Q9Y5E1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCDHB9Q9Y5E1 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCDHB9Q9Y5E1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PCDHB9Q9Y5E1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PCDHB9Q9Y5E1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms