Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PLXND1Q9Y4D7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PLXND1Q9Y4D7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PLXND1Q9Y4D7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
PLXND1Q9Y4D7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PLXND1Q9Y4D7 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PLXND1Q9Y4D7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PLXND1Q9Y4D7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXND1Q9Y4D7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXND1Q9Y4D7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXND1Q9Y4D7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PLXND1Q9Y4D7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms