Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J0

RPH3A, Rabphilin-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPH3AQ9Y2J0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPH3AQ9Y2J0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPH3AQ9Y2J0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPH3AQ9Y2J0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPH3AQ9Y2J0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPH3AQ9Y2J0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPH3AQ9Y2J0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 352 ms