Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU5

USP24, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 24, humanhuman

Predictions only

Length 2,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP24Q9UPU5 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP24Q9UPU5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
USP24Q9UPU5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
USP24Q9UPU5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP24Q9UPU5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP24Q9UPU5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP24Q9UPU5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP24Q9UPU5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP24Q9UPU5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP24Q9UPU5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP24Q9UPU5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP24Q9UPU5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
USP24Q9UPU5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP24Q9UPU5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP24Q9UPU5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP24Q9UPU5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP24Q9UPU5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP24Q9UPU5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP24Q9UPU5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP24Q9UPU5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP24Q9UPU5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP24Q9UPU5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
USP24Q9UPU5 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
USP24Q9UPU5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP24Q9UPU5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP24Q9UPU5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
USP24Q9UPU5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms