Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR5

SLC8A2, Sodium/calcium exchanger 2, humanhuman

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A2Q9UPR5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC8A2Q9UPR5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC8A2Q9UPR5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SLC8A2Q9UPR5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC8A2Q9UPR5 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC8A2Q9UPR5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC8A2Q9UPR5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC8A2Q9UPR5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC8A2Q9UPR5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms