Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LHX6Q9UPM6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LHX6Q9UPM6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
LHX6Q9UPM6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LHX6Q9UPM6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LHX6Q9UPM6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LHX6Q9UPM6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms