Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP52

TFR2, Transferrin receptor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFR2Q9UP52 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TFR2Q9UP52 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TFR2Q9UP52 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFR2Q9UP52 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFR2Q9UP52 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFR2Q9UP52 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TFR2Q9UP52 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
TFR2Q9UP52 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TFR2Q9UP52 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TFR2Q9UP52 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
TFR2Q9UP52 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TFR2Q9UP52 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TFR2Q9UP52 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFR2Q9UP52 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TFR2Q9UP52 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFR2Q9UP52 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFR2Q9UP52 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFR2Q9UP52 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFR2Q9UP52 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFR2Q9UP52 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
TFR2Q9UP52 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TFR2Q9UP52 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TFR2Q9UP52 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TFR2Q9UP52 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFR2Q9UP52 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
TFR2Q9UP52 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms