Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULP0

NDRG4, Protein NDRG4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG4Q9ULP0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDRG4Q9ULP0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDRG4Q9ULP0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDRG4Q9ULP0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NDRG4Q9ULP0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NDRG4Q9ULP0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NDRG4Q9ULP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDRG4Q9ULP0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NDRG4Q9ULP0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NDRG4Q9ULP0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NDRG4Q9ULP0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDRG4Q9ULP0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NDRG4Q9ULP0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NDRG4Q9ULP0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NDRG4Q9ULP0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NDRG4Q9ULP0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms