Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL42

PNMA2, Paraneoplastic antigen Ma2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA2Q9UL42 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PNMA2Q9UL42 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PNMA2Q9UL42 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PNMA2Q9UL42 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
PNMA2Q9UL42 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PNMA2Q9UL42 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.45■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
PNMA2Q9UL42 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PNMA2Q9UL42 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PNMA2Q9UL42 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PNMA2Q9UL42 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PNMA2Q9UL42 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms