Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAPPC2LQ9UL33 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TRAPPC2LQ9UL33 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRAPPC2LQ9UL33 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TRAPPC2LQ9UL33 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRAPPC2LQ9UL33 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRAPPC2LQ9UL33 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms