Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PACSIN3Q9UKS6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PACSIN3Q9UKS6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PACSIN3Q9UKS6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PACSIN3Q9UKS6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PACSIN3Q9UKS6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PACSIN3Q9UKS6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms