Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDC42EP3Q9UKI2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDC42EP3Q9UKI2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDC42EP3Q9UKI2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
CDC42EP3Q9UKI2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CDC42EP3Q9UKI2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms