Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRTO4Q9UKD2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MRTO4Q9UKD2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MRTO4Q9UKD2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MRTO4Q9UKD2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MRTO4Q9UKD2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MRTO4Q9UKD2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRTO4Q9UKD2 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms