Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SALL4Q9UJQ4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SALL4Q9UJQ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SALL4Q9UJQ4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SALL4Q9UJQ4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL4Q9UJQ4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SALL4Q9UJQ4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SALL4Q9UJQ4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SALL4Q9UJQ4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SALL4Q9UJQ4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL4Q9UJQ4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SALL4Q9UJQ4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL4Q9UJQ4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SALL4Q9UJQ4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL4Q9UJQ4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SALL4Q9UJQ4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SALL4Q9UJQ4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SALL4Q9UJQ4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL4Q9UJQ4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL4Q9UJQ4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SALL4Q9UJQ4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL4Q9UJQ4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SALL4Q9UJQ4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SALL4Q9UJQ4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SALL4Q9UJQ4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SALL4Q9UJQ4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SALL4Q9UJQ4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SALL4Q9UJQ4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SALL4Q9UJQ4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SALL4Q9UJQ4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SALL4Q9UJQ4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SALL4Q9UJQ4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms