Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ94

LINC00527, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00527, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00527Q9UJ94 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LINC00527Q9UJ94 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
LINC00527Q9UJ94 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
LINC00527Q9UJ94 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
LINC00527Q9UJ94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
LINC00527Q9UJ94 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00527Q9UJ94 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
LINC00527Q9UJ94 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
LINC00527Q9UJ94 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms