Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGQ2

CACFD1, Calcium channel flower homolog, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACFD1Q9UGQ2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CACFD1Q9UGQ2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CACFD1Q9UGQ2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CACFD1Q9UGQ2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CACFD1Q9UGQ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CACFD1Q9UGQ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms