Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CHRNA9Q9UGM1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CHRNA9Q9UGM1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CHRNA9Q9UGM1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CHRNA9Q9UGM1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHRNA9Q9UGM1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHRNA9Q9UGM1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms