Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XCL2Q9UBD3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
XCL2Q9UBD3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XCL2Q9UBD3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XCL2Q9UBD3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
XCL2Q9UBD3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
XCL2Q9UBD3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XCL2Q9UBD3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
XCL2Q9UBD3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
XCL2Q9UBD3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
XCL2Q9UBD3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
XCL2Q9UBD3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
XCL2Q9UBD3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
XCL2Q9UBD3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
XCL2Q9UBD3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.6 ms