Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC2

EPS15L1, Epidermal growth factor receptor substrate 15-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPS15L1Q9UBC2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EPS15L1Q9UBC2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPS15L1Q9UBC2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
EPS15L1Q9UBC2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EPS15L1Q9UBC2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EPS15L1Q9UBC2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EPS15L1Q9UBC2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
EPS15L1Q9UBC2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EPS15L1Q9UBC2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPS15L1Q9UBC2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPS15L1Q9UBC2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPS15L1Q9UBC2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPS15L1Q9UBC2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPS15L1Q9UBC2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPS15L1Q9UBC2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms