Protein–RNA interactions for Protein: Q9P299

COPZ2, Coatomer subunit zeta-2, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPZ2Q9P299 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COPZ2Q9P299 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COPZ2Q9P299 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPZ2Q9P299 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
COPZ2Q9P299 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
COPZ2Q9P299 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COPZ2Q9P299 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COPZ2Q9P299 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms