Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HCN3Q9P1Z3 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HCN3Q9P1Z3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HCN3Q9P1Z3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HCN3Q9P1Z3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HCN3Q9P1Z3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HCN3Q9P1Z3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms