Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0Z9

PIPOX, Peroxisomal sarcosine oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPOXQ9P0Z9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIPOXQ9P0Z9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIPOXQ9P0Z9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PIPOXQ9P0Z9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PIPOXQ9P0Z9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PIPOXQ9P0Z9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms