Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
NDUFA13Q9P0J0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
NDUFA13Q9P0J0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFA13Q9P0J0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFA13Q9P0J0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
NDUFA13Q9P0J0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
NDUFA13Q9P0J0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
NDUFA13Q9P0J0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFA13Q9P0J0 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
NDUFA13Q9P0J0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
NDUFA13Q9P0J0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NDUFA13Q9P0J0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NDUFA13Q9P0J0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NDUFA13Q9P0J0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDUFA13Q9P0J0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDUFA13Q9P0J0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms