Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SACSQ9NZJ4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SACSQ9NZJ4 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
SACSQ9NZJ4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SACSQ9NZJ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SACSQ9NZJ4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SACSQ9NZJ4 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms