Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
NKIRAS1Q9NYS0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NKIRAS1Q9NYS0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NKIRAS1Q9NYS0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
NKIRAS1Q9NYS0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKIRAS1Q9NYS0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NKIRAS1Q9NYS0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NKIRAS1Q9NYS0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKIRAS1Q9NYS0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NKIRAS1Q9NYS0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKIRAS1Q9NYS0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NKIRAS1Q9NYS0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NKIRAS1Q9NYS0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NKIRAS1Q9NYS0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NKIRAS1Q9NYS0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NKIRAS1Q9NYS0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKIRAS1Q9NYS0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NKIRAS1Q9NYS0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NKIRAS1Q9NYS0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms