Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RDH8Q9NYR8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RDH8Q9NYR8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RDH8Q9NYR8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RDH8Q9NYR8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RDH8Q9NYR8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RDH8Q9NYR8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RDH8Q9NYR8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 165.7 ms