Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NDFIP2Q9NV92 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NDFIP2Q9NV92 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms