Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV92

NDFIP2, NEDD4 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP2Q9NV92 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NDFIP2Q9NV92 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
NDFIP2Q9NV92 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NDFIP2Q9NV92 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NDFIP2Q9NV92 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
NDFIP2Q9NV92 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NDFIP2Q9NV92 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NDFIP2Q9NV92 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NDFIP2Q9NV92 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms