Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV44

LINC00846, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00846, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00846Q9NV44 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00846Q9NV44 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00846Q9NV44 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC00846Q9NV44 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LINC00846Q9NV44 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LINC00846Q9NV44 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms