Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ABCF3Q9NUQ8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCF3Q9NUQ8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCF3Q9NUQ8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ABCF3Q9NUQ8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ABCF3Q9NUQ8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF3Q9NUQ8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ABCF3Q9NUQ8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCF3Q9NUQ8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ABCF3Q9NUQ8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ABCF3Q9NUQ8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ABCF3Q9NUQ8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCF3Q9NUQ8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCF3Q9NUQ8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ABCF3Q9NUQ8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ABCF3Q9NUQ8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ABCF3Q9NUQ8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms