Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCM2LQ9NUG4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCM2LQ9NUG4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CCM2LQ9NUG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCM2LQ9NUG4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCM2LQ9NUG4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCM2LQ9NUG4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCM2LQ9NUG4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCM2LQ9NUG4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCM2LQ9NUG4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms