Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RPRMQ9NS64 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RPRMQ9NS64 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RPRMQ9NS64 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
RPRMQ9NS64 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RPRMQ9NS64 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
RPRMQ9NS64 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms